Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GFRA2O00451 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA2O00451 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms