Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRBA1A5PL33 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRBA1A5PL33 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms