Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VPS37CA5D8V6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS37CA5D8V6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS37CA5D8V6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms