Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPAARA0A1B0GVQ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms