Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA3Q96KX2 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA3Q96KX2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA3Q96KX2 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA3Q96KX2 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA3Q96KX2 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA3Q96KX2 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA3Q96KX2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA3Q96KX2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA3Q96KX2 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CAPZA3Q96KX2 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAPZA3Q96KX2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms