Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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