Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP8P40818 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP8P40818 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP8P40818 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP8P40818 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP8P40818 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP8P40818 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP8P40818 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP8P40818 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP8P40818 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP8P40818 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USP8P40818 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms