Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SCG3Q8WXD2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SCG3Q8WXD2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SCG3Q8WXD2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SCG3Q8WXD2 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SCG3Q8WXD2 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SCG3Q8WXD2 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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