Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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ATG16L1Q676U5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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ATG16L1Q676U5 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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ATG16L1Q676U5 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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ATG16L1Q676U5 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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ATG16L1Q676U5 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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