Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C17orf58Q2M2W7 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms