Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms