Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms