Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC087762.1-201ENST00000559755 643 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRHP20396 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 AL392185.1-201ENST00000419620 395 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 SLC25A5P6-201ENST00000515328 886 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC087463.4-201ENST00000561964 448 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC009166.1-201ENST00000570060 487 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC092069.1-201ENST00000589120 270 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 SRGAP3-AS2-203ENST00000600323 1294 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRHP20396 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 RN7SL833P-201ENST00000498758 284 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 KIAA1191-211ENST00000533553 560 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 SERF1A-209ENST00000513436 1693 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRHP20396 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRHP20396 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRHP20396 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRHP20396 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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