Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms