Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IMPG1Q17R60 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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