Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms