Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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LSAMPQ13449 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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LSAMPQ13449 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LSAMPQ13449 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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