Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM60AQ9NP50 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms