Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HERC3Q15034 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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