Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 NSMCE2-208ENST00000520866 1183 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 OR10AE1P-201ENST00000606962 1029 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AC069208.1-206ENST00000538905 832 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AC009269.2-201ENST00000559892 474 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CAMK2BQ13554 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms