Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms