Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms