Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GGCXP38435 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GGCXP38435 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms