Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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NUP35Q8NFH5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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NUP35Q8NFH5 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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NUP35Q8NFH5 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NUP35Q8NFH5 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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