Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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