Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 RPS20P22-202ENST00000488192 1318 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC013469.1-201ENST00000426985 403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC093297.2-201ENST00000503452 738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC009269.2-201ENST00000559892 474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC066613.2-201ENST00000561007 560 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSEN1P49768 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms