Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK8P49336 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK8P49336 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms