Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms