Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RLBP1P12271 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms