Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRTQ9BXP5 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRTQ9BXP5 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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