Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 UGT1A7-201ENST00000373426 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SIGLEC8-201ENST00000321424 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC009159.4-201ENST00000624606 2031 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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