Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms