Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAEP38570 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms