Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TPM2P07951 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TPM2P07951 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPM2P07951 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPM2P07951 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPM2P07951 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPM2P07951 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPM2P07951 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPM2P07951 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPM2P07951 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPM2P07951 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPM2P07951 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPM2P07951 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPM2P07951 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms