Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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