Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms