Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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