Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MCF2LO15068 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCF2LO15068 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCF2LO15068 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms