Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A2

CYP46A1, Cholesterol 24-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP46A1Q9Y6A2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP46A1Q9Y6A2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYP46A1Q9Y6A2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP46A1Q9Y6A2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP46A1Q9Y6A2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP46A1Q9Y6A2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP46A1Q9Y6A2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP46A1Q9Y6A2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms