Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD2APQ9Y5K6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD2APQ9Y5K6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD2APQ9Y5K6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD2APQ9Y5K6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CD2APQ9Y5K6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD2APQ9Y5K6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD2APQ9Y5K6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD2APQ9Y5K6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD2APQ9Y5K6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD2APQ9Y5K6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD2APQ9Y5K6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD2APQ9Y5K6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD2APQ9Y5K6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD2APQ9Y5K6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD2APQ9Y5K6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CD2APQ9Y5K6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms