Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9Y3F1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9Y3F1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms