Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCA2Q9UQC9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms