Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXNB3Q9ULL4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNB3Q9ULL4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNB3Q9ULL4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms