Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCNL1Q9UK58 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCNL1Q9UK58 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCNL1Q9UK58 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms