Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
MLH3Q9UHC1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MLH3Q9UHC1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms