Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDAC6Q9UBN7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC6Q9UBN7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms