Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW07

ZNF358, Zinc finger protein 358, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF358Q9NW07 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF358Q9NW07 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF358Q9NW07 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF358Q9NW07 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms