Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM39AQ9NV64 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM39AQ9NV64 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 373.2 ms