Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XPNPEP3Q9NQH7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XPNPEP3Q9NQH7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms