Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP9-3Q9BYQ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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